More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3077 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  97.06 
 
 		 238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  88.24 
 
 		 238 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  73.53 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  64.88 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  66.26 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  51.13 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  46.05 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  51.26 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  46.25 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.64 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  45.13 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  45.58 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  47.8 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  46.26 
 
 		 251 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  47.88 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  44.02 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  46.19 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.92 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.97 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.2 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.24 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  36.89 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  38.39 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.98 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  39.33 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 		 278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  37.6 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  34.8 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 258 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  37.92 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  42.5 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 352 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 		 516 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 		 263 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 352 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0444  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.98 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1657  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  37.82 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.41 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0578  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  36.73 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1269  phosphate transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237624  normal  0.121063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  38.6 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.82 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 		 510 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  35.17 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.2 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 299 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.61654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  35.68 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 		 263 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  39.83 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  36.33 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.66 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 		 594 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>