More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2882 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  99.33 
 
 
298 aa  580  1e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
298 aa  583  1e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  90.54 
 
 
298 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  76.77 
 
 
298 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  76.27 
 
 
297 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  75.42 
 
 
298 aa  404  1e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  60.27 
 
 
297 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  58.59 
 
 
296 aa  319  4e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  60.07 
 
 
297 aa  307  1e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  59.6 
 
 
297 aa  305  5e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  58.92 
 
 
299 aa  305  5e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  56.04 
 
 
295 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  58.39 
 
 
297 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  55 
 
 
299 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 
299 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 
295 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  55.7 
 
 
299 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 
309 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  54.55 
 
 
296 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 
296 aa  283  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 
296 aa  279  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  53.36 
 
 
296 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  66.06 
 
 
226 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.44 
 
 
289 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  62.76 
 
 
241 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  53.04 
 
 
291 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 
291 aa  266  3e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.74 
 
 
292 aa  265  6e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 
291 aa  265  9e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  53.38 
 
 
291 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  53.87 
 
 
325 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  52.23 
 
 
291 aa  252  5e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  48.14 
 
 
291 aa  242  4e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  56.68 
 
 
292 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  47.97 
 
 
332 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  47.51 
 
 
299 aa  225  5e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
298 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 
294 aa  216  3e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 
404 aa  211  8e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  48.51 
 
 
404 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 
404 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 
415 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  47.88 
 
 
418 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.24 
 
 
302 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.72 
 
 
418 aa  200  2e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.61 
 
 
398 aa  200  2e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  47.1 
 
 
404 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  47.45 
 
 
429 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  50.42 
 
 
404 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 
284 aa  196  5e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 
297 aa  196  5e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  46.33 
 
 
429 aa  195  8e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  49.59 
 
 
404 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.34 
 
 
410 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  43.31 
 
 
307 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  50.95 
 
 
236 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 
275 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  40.91 
 
 
278 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  47.01 
 
 
281 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  51.5 
 
 
237 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  49.08 
 
 
236 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.78 
 
 
411 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  49.04 
 
 
264 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.33 
 
 
325 aa  184  1e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 
429 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  51.23 
 
 
241 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47 
 
 
435 aa  182  4e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 
279 aa  182  5e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  39.55 
 
 
410 aa  182  5e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 
326 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  46.09 
 
 
285 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.03 
 
 
420 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  42.19 
 
 
403 aa  180  3e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 
326 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.92 
 
 
326 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.8 
 
 
281 aa  179  5e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 
285 aa  179  5e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  39.76 
 
 
398 aa  179  5e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41 
 
 
410 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  48.57 
 
 
235 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 
237 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.2 
 
 
406 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.51 
 
 
404 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 
310 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 
237 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.79 
 
 
419 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  45.04 
 
 
405 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.53 
 
 
438 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40.27 
 
 
432 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.29 
 
 
404 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  50.93 
 
 
294 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
281 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
281 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
316 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  42.06 
 
 
408 aa  174  1e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
410 aa  174  2e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 
400 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>