283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2827 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 258 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  98.84 
 
 		 258 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  92.64 
 
 		 258 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  71.26 
 
 		 253 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  66.54 
 
 		 254 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  66.54 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  46.47 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  47.06 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  47.28 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  46.69 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  45.45 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  46.69 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  42.8 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  45.61 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  42.21 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  35.44 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.76 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  39.64 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  33.61 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.27 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  38.27 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  38.03 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  35.27 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  26.21 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  34.02 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  32.75 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.71 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.21 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  29.73 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  31.28 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.29 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.13 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  36 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  36.4 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  27.5 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  26.34 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  29.05 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  31.93 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  32.23 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  30.14 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  31.36 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  30.84 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  36.04 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.32 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  30.29 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.95 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.53 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.3 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  34.43 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.49 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  30.6 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.51 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  31.65 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.83 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.27 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  28.89 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  30.41 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  29.75 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  29.75 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  29.75 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  29.76 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  29.81 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.74 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  33.53 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.02 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.22 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>