More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2582 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  99.49 
 
 
390 aa  798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  85.64 
 
 
390 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  95.9 
 
 
390 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
390 aa  802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80 
 
 
390 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  77.44 
 
 
389 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  77.95 
 
 
389 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  87.69 
 
 
390 aa  734    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  81.79 
 
 
390 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  86.67 
 
 
390 aa  732    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.15 
 
 
395 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  76.21 
 
 
391 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  76.47 
 
 
391 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  74.87 
 
 
389 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  73.91 
 
 
391 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.41 
 
 
391 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 
389 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.82 
 
 
390 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.79 
 
 
389 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.79 
 
 
389 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.56 
 
 
389 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  60.77 
 
 
433 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.54 
 
 
391 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.85 
 
 
389 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.74 
 
 
388 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.31 
 
 
389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.44 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3017  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  58.72 
 
 
520 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.54 
 
 
392 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  58.06 
 
 
386 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.29 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3146  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  58.72 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.14 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1366  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  58.46 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  57.44 
 
 
391 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  57.4 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.52 
 
 
393 aa  458  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.89 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.89 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  56.89 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  56.63 
 
 
394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.73 
 
 
401 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.96 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.22 
 
 
389 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.48 
 
 
401 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  53.44 
 
 
399 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.71 
 
 
405 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5460  alcohol dehydrogenase  57.69 
 
 
391 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.69 
 
 
389 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.94 
 
 
390 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  50.38 
 
 
388 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.62 
 
 
396 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.38 
 
 
388 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
389 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  50.38 
 
 
388 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.62 
 
 
388 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.55 
 
 
389 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.45 
 
 
389 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.43 
 
 
386 aa  346  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.24 
 
 
389 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1803  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.27 
 
 
392 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.56 
 
 
387 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.56 
 
 
390 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.63 
 
 
403 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  46.12 
 
 
388 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
400 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.41 
 
 
385 aa  329  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.01 
 
 
393 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.73 
 
 
411 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 
411 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.8 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.84 
 
 
400 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
400 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.9 
 
 
385 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 
396 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.55 
 
 
384 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.19 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.02 
 
 
387 aa  323  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
391 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.94 
 
 
412 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  45.94 
 
 
412 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.69 
 
 
412 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.79 
 
 
393 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 
412 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.69 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.69 
 
 
412 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.27 
 
 
392 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  45.69 
 
 
412 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.79 
 
 
393 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.69 
 
 
412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  45.69 
 
 
412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  45.69 
 
 
412 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4749  alcohol dehydrogenase  47.03 
 
 
393 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.69 
 
 
412 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
388 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
384 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.04 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554879  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  44.02 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
385 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>