More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2399 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
726 aa  1455    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  98.76 
 
 
726 aa  1437    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  85.7 
 
 
743 aa  1278    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  63.91 
 
 
726 aa  887    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
815 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 
825 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 
825 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
708 aa  357  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
860 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.94 
 
 
708 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
709 aa  340  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
850 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
696 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.91 
 
 
703 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 
734 aa  333  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
703 aa  333  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.63 
 
 
703 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 
741 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
708 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.52 
 
 
696 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
711 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 
714 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 
862 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
732 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 
859 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
701 aa  323  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
722 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.83 
 
 
709 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.49 
 
 
711 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
843 aa  320  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 
736 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
710 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
715 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
730 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
689 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
817 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
864 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
837 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
738 aa  303  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
692 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 
757 aa  288  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 
710 aa  287  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
722 aa  285  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 
821 aa  277  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 
726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 
701 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 
701 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.66 
 
 
801 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
700 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.39 
 
 
799 aa  273  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
701 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
701 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
829 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 
755 aa  264  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 
792 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
701 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
689 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31.53 
 
 
689 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
698 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
701 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
701 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
689 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 
707 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
770 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 
794 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 
710 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 
727 aa  256  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 
722 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 
796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 
799 aa  255  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  30.24 
 
 
703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 
719 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 
796 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
771 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
747 aa  253  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 
705 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 
796 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
796 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 
710 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.44 
 
 
706 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
819 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 
745 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
694 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 
753 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.19 
 
 
833 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 
733 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
724 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
742 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 
720 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
829 aa  244  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
721 aa  243  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.65 
 
 
713 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.68 
 
 
713 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
707 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.68 
 
 
713 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
715 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
744 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>