22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2269 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2269  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1992  hypothetical protein  98.37 
 
 
184 aa  356  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1947  hypothetical protein  88.59 
 
 
184 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26145  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6011  hypothetical protein  54.13 
 
 
133 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.83036  normal  0.0239799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  33.08 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  29.59 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  23.78 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  34.62 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  25.87 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  32.35 
 
 
201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  31.4 
 
 
198 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  31.4 
 
 
198 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  27.01 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  28.92 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  30.88 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2762  hypothetical protein  41.86 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  26.96 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  31.88 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  35.09 
 
 
180 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  32.56 
 
 
158 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  27.94 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>