More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2225 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  66.06 
 
 
728 aa  844  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  61.78 
 
 
721 aa  827  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  63.33 
 
 
775 aa  780  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  96.79 
 
 
717 aa  1305  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
717 aa  1417  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  89.72 
 
 
710 aa  1245  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 
958 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 
765 aa  541  1e-152  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  47.96 
 
 
733 aa  540  1e-152  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
625 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
625 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 
632 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 
1509 aa  518  1e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  50.09 
 
 
1275 aa  518  1e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 
1334 aa  502  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  43.97 
 
 
731 aa  495  1e-138  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.19 
 
 
1561 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  46.36 
 
 
625 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  46.65 
 
 
723 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  40.03 
 
 
709 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  40.03 
 
 
709 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 
1152 aa  472  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  40.75 
 
 
1152 aa  471  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 
1067 aa  439  1e-122  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
746 aa  428  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
734 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  44.46 
 
 
880 aa  426  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  41.27 
 
 
790 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  45.47 
 
 
1084 aa  422  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.96 
 
 
1486 aa  416  1e-115  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
658 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  38.43 
 
 
1991 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42.18 
 
 
983 aa  400  1e-110  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  38.69 
 
 
810 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  40.29 
 
 
742 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
742 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 
742 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
832 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.87 
 
 
857 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
996 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 
794 aa  357  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
988 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  39.78 
 
 
1182 aa  351  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  35.33 
 
 
783 aa  340  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  7.17832e-06  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
586 aa  338  2e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  38.04 
 
 
602 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 
617 aa  325  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.04 
 
 
610 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
684 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  42.46 
 
 
531 aa  305  2e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
729 aa  305  2e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 
670 aa  301  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  44.72 
 
 
635 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
2046 aa  293  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  44.02 
 
 
526 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  40.9 
 
 
555 aa  282  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 
652 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  41.74 
 
 
632 aa  281  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
958 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
662 aa  277  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
684 aa  277  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  40.64 
 
 
539 aa  273  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
551 aa  271  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
732 aa  270  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 
551 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.29 
 
 
809 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
808 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
725 aa  262  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
1359 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.69 
 
 
1644 aa  260  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.69 
 
 
1644 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
796 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 
725 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 
783 aa  256  1e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 
1759 aa  252  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 
1009 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
576 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
1297 aa  238  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
1213 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
1190 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
784 aa  224  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
556 aa  218  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 
1191 aa  214  3e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
1188 aa  214  3e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
1193 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.78 
 
 
1198 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
748 aa  194  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  32.42 
 
 
1694 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
1074 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
974 aa  167  6e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
510 aa  165  2e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
1177 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  32.77 
 
 
1003 aa  164  4e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
968 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  38.66 
 
 
1171 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  32.13 
 
 
1165 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  32.13 
 
 
1165 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.37 
 
 
968 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
1187 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
1386 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>