43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2175 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  97.74 
 
 		 177 aa  358  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  84.83 
 
 		 178 aa  298  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  59.09 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  48.05 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  48.05 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.05 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  49.04 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  45.25 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  45.51 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  46.1 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  41.71 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  44.52 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  39.47 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  38.82 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  38.82 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  40.25 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  39.47 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  39.75 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  35.5 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  36.63 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  35 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  38.56 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  35.06 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  36.71 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  36.18 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  36.48 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  31.93 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  25.86 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  30.11 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  34.12 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  29.32 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  35.96 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  28.1 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.32 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  28.75 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  30.61 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>