74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2174 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  100 
 
 
176 aa  357  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  99.43 
 
 
176 aa  356  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  96.02 
 
 
176 aa  321  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  69.32 
 
 
179 aa  243  1e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  74.68 
 
 
179 aa  233  1e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  61.2 
 
 
187 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  60.62 
 
 
178 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  65.16 
 
 
183 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  55.75 
 
 
175 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  59.62 
 
 
177 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  52.23 
 
 
173 aa  161  5e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  49.69 
 
 
178 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  47.16 
 
 
177 aa  154  5e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  44.07 
 
 
177 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  46.59 
 
 
177 aa  152  3e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  47.9 
 
 
181 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  53.33 
 
 
185 aa  145  4e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  43.53 
 
 
184 aa  138  5e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  45.06 
 
 
178 aa  135  3e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  45.86 
 
 
177 aa  134  7e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  43.42 
 
 
183 aa  132  2e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  43.87 
 
 
176 aa  130  1e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  43.23 
 
 
176 aa  126  1e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  43.87 
 
 
176 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  38.24 
 
 
174 aa  120  1e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  44.17 
 
 
176 aa  113  1e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  38.46 
 
 
176 aa  107  9e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  31.28 
 
 
177 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  38.46 
 
 
181 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  32.94 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  39.41 
 
 
157 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  37.71 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  38.36 
 
 
157 aa  80.1  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  36.91 
 
 
161 aa  77.8  8e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  33.33 
 
 
168 aa  73.6  1e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  35.62 
 
 
158 aa  73.9  1e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  71.2  7e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  67.8  9e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.25 
 
 
136 aa  65.9  3e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  56.6  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  56.6  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  27.01 
 
 
135 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.4  3e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.4  3e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.4  3e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.4  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  27.66 
 
 
138 aa  52.4  4e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  28.19 
 
 
138 aa  50.4  1e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  50.8  1e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  28.19 
 
 
138 aa  50.4  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  28.19 
 
 
138 aa  50.1  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  26.06 
 
 
138 aa  48.9  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  26.95 
 
 
138 aa  48.9  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  30.89 
 
 
168 aa  49.3  3e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  25.58 
 
 
164 aa  48.5  4e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  25.5 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  32.89 
 
 
142 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  27.03 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  32.71 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  21.29 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.28 
 
 
143 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00902  hypothetical protein  32.04 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  25.17 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  27.07 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  27.68 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>