69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2103 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  97.88 
 
 		 236 aa  351  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  67.51 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  62.34 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  63.55 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  31.75 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5233  hypothetical protein  28.05 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5308  hypothetical protein  29.75 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4766  hypothetical protein  29.34 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4061  hypothetical protein  28.85 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.507546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  41.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  37.97 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  46.67 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  40.58 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  38.27 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  30 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  40.79 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  40.79 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.78 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  36.51 
 
 		 186 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  39.47 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  40.79 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  40.79 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  40.79 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  40.79 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  38.16 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0840  hypothetical protein  39.47 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0792488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  32.43 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  25.62 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  38.18 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  36.99 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  39.47 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  34.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  35.92 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  51.52 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  48.72 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  35.85 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  51.52 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  44.68 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  35.29 
 
 		 167 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  33.82 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  38.78 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  37.68 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  36.07 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  32.08 
 
 		 200 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  34.29 
 
 		 234 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>