More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2056 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  98.39 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  94.69 
 
 		 247 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  83.83 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  74.45 
 
 		 231 aa  351  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  74.01 
 
 		 231 aa  351  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  74.01 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  74.01 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  73.57 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  75.45 
 
 		 230 aa  348  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  75.45 
 
 		 231 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  75.45 
 
 		 230 aa  348  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  73.87 
 
 		 248 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  75.33 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  74.89 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  71.67 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  70.45 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  68.89 
 
 		 233 aa  325  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  64.71 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  62.82 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  35.51 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.39 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.11 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.55 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  35.45 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  32.31 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.78 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.62 
 
 		 389 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.38 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  31.58 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.72 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  30.22 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  34.53 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 201 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  29.6 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30.4 
 
 		 231 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.05 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 204 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 196 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.63 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  32.73 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  32.73 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  32.73 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  27.43 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  34.98 
 
 		 203 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  35.54 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  86.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.74 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  34.39 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  32.7 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  31.48 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  31.48 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>