161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2035 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 323 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  97.83 
 
 		 323 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  93.81 
 
 		 323 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  37.65 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.56 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36.59 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.76 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  35.2 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  35.05 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  34.73 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.76 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.12 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  30.3 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  32.9 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  34.48 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  37.07 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  34.88 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.49 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  35.14 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  36.55 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  33.03 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.44 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.81 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.92 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  33.1 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.19 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.68 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  34 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  34.11 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  32.21 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  30.25 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  36.58 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  31.65 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  32.89 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.79 
 
 		 344 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.21 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.79 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  35.02 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  32.34 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  31.21 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  25.43 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  31.33 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.12 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  31.82 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  29.79 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  32.5 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  28.4 
 
 		 564 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  27.97 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.45 
 
 		 367 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  30.22 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.22 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  26.51 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  29.2 
 
 		 406 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  32.22 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  26.21 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  27.61 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  28.44 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  27.86 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.7 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.7 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  23.77 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.24 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  31.91 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  28.14 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  32.04 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>