186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1904 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  97.79 
 
 
271 aa  515  1e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  88.97 
 
 
265 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  61.48 
 
 
255 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  63.03 
 
 
252 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  62.55 
 
 
252 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  58.44 
 
 
265 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  52.67 
 
 
647 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  53.05 
 
 
263 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  58.33 
 
 
257 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  56.08 
 
 
261 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  53.94 
 
 
261 aa  254  1e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  57.85 
 
 
257 aa  253  2e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  51.82 
 
 
259 aa  252  5e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  56.2 
 
 
265 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  51.42 
 
 
257 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  58.26 
 
 
264 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  51.42 
 
 
274 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  51.2 
 
 
277 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  53.28 
 
 
258 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  46.99 
 
 
272 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  49.6 
 
 
269 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  47.88 
 
 
259 aa  225  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  51.28 
 
 
290 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  50 
 
 
272 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  49.37 
 
 
248 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 
264 aa  200  2e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  47.92 
 
 
249 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.07 
 
 
248 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.17 
 
 
247 aa  184  2e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  48.94 
 
 
252 aa  182  5e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  44.02 
 
 
251 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  45.42 
 
 
249 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 
254 aa  165  1e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.03 
 
 
244 aa  164  2e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 
253 aa  158  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  41.67 
 
 
248 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.1 
 
 
260 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  32.8 
 
 
257 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  34.98 
 
 
279 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.47 
 
 
276 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.47 
 
 
276 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.32 
 
 
258 aa  61.6  1e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.98 
 
 
261 aa  61.2  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
256 aa  57.4  2e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  25 
 
 
274 aa  56.6  4e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.44 
 
 
254 aa  54.3  2e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  53.5  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 
308 aa  53.9  3e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
294 aa  53.1  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
275 aa  52.8  6e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.65 
 
 
371 aa  52  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.65 
 
 
371 aa  52  1e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 
371 aa  50.8  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
250 aa  51.2  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
255 aa  51.2  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  42.11 
 
 
387 aa  51.2  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.59 
 
 
374 aa  51.2  2e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  43.42 
 
 
387 aa  51.2  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.73 
 
 
248 aa  50.4  3e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
250 aa  50.8  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.07 
 
 
370 aa  50.1  5e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 
311 aa  49.3  7e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
250 aa  48.9  8e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  28.02 
 
 
264 aa  49.3  8e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.99 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  43.24 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.04 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  26.53 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
274 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 
272 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
297 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.41 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.65 
 
 
246 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.15 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.06 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>