More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1876 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 744 aa  1497    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  99.19 
 
 		 744 aa  1491    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  54.55 
 
 		 750 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  72.53 
 
 		 745 aa  1046    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  59.66 
 
 		 747 aa  845    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  43.81 
 
 		 754 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 829 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 815 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  39.51 
 
 		 806 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  41.51 
 
 		 769 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.01 
 
 		 833 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 		 789 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  36.83 
 
 		 729 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  38.99 
 
 		 801 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40.76 
 
 		 778 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 		 733 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 		 745 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 738 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  37.66 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 741 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 737 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  36.81 
 
 		 719 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 		 812 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  37.66 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 752 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  39.01 
 
 		 821 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 771 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 723 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  35.7 
 
 		 718 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  36.05 
 
 		 808 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 		 771 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  37 
 
 		 729 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  36.2 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  35.45 
 
 		 719 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  35.93 
 
 		 740 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 863 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 750 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  36.97 
 
 		 734 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 808 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 		 829 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 714 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  35.91 
 
 		 753 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 750 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 740 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 750 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.3 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 753 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 717 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 		 831 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 		 757 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  35.52 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  35.66 
 
 		 729 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 		 725 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 		 725 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 819 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.19 
 
 		 806 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 738 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 817 aa  386  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 810 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 		 725 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.82 
 
 		 745 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 745 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 820 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 794 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.73 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.97 
 
 		 689 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 810 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 719 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.43 
 
 		 703 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.43 
 
 		 703 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  33.59 
 
 		 747 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  34.27 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 		 737 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.73 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.75 
 
 		 779 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 735 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 745 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.29 
 
 		 729 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.73 
 
 		 747 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 828 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 		 729 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  33.76 
 
 		 747 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 828 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 797 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.39 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 		 797 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 701 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>