More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1742 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  91.67 
 
 
133 aa  247  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  76.52 
 
 
133 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  62.88 
 
 
133 aa  169  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  62.12 
 
 
133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 
133 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.08 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.86 
 
 
132 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  50 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.69 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.74 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
137 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.57 
 
 
86 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.08 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.75 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.96 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.96 
 
 
135 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.27 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.56 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.04 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.16 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.12 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.49 
 
 
135 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.37 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.16 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.19 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.32 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.02 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.02 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.31 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
139 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  36 
 
 
133 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.76 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.7 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.81 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.98 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  42.86 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.23 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  43.68 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.98 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.54 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.07 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.98 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.96 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.17 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.21 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.57 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.62 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.58 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.45 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.07 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.96 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.61 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.2 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>