56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1725 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  97.77 
 
 
179 aa  361  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  86.59 
 
 
179 aa  330  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  87.15 
 
 
181 aa  329  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  87.15 
 
 
181 aa  327  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  78.77 
 
 
179 aa  301  4e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  71.91 
 
 
178 aa  285  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  63.16 
 
 
177 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  63.64 
 
 
177 aa  237  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  63.1 
 
 
177 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  63.03 
 
 
181 aa  232  2e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  54.49 
 
 
183 aa  212  2e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  42.86 
 
 
211 aa  137  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  38.73 
 
 
182 aa  129  2e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  42.77 
 
 
165 aa  118  4e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  38.95 
 
 
182 aa  116  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  37.5 
 
 
182 aa  114  9e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  36.9 
 
 
182 aa  111  4e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  36.9 
 
 
182 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  36.31 
 
 
182 aa  109  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 
178 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  36.3 
 
 
160 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.93 
 
 
396 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  39.04 
 
 
392 aa  92  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.36 
 
 
393 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  38.36 
 
 
167 aa  83.6  1e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  34.88 
 
 
171 aa  83.6  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  34.88 
 
 
171 aa  82.8  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.93 
 
 
392 aa  83.2  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.25 
 
 
393 aa  81.6  6e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 
170 aa  80.9  9e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 
170 aa  79.7  2e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 
170 aa  79.7  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 
170 aa  79.7  2e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  35.14 
 
 
170 aa  78.6  4e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  33.56 
 
 
169 aa  78.6  4e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 
169 aa  78.6  5e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  34.43 
 
 
169 aa  78.2  6e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.82 
 
 
403 aa  77.4  1e-13  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  31.51 
 
 
175 aa  76.3  2e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  32.39 
 
 
191 aa  73.9  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  34.11 
 
 
169 aa  72.4  3e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  28.08 
 
 
178 aa  70.9  9e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  32.89 
 
 
169 aa  70.9  1e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  32.21 
 
 
170 aa  69.3  3e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.25 
 
 
393 aa  68.9  4e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  33.58 
 
 
167 aa  68.6  4e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 
190 aa  67.8  7e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  27.4 
 
 
174 aa  64.3  9e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  28.08 
 
 
178 aa  62.8  3e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  30.66 
 
 
167 aa  60.5  1e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  28.77 
 
 
393 aa  60.5  1e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  30.66 
 
 
167 aa  60.8  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  30.66 
 
 
167 aa  60.8  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.8 
 
 
391 aa  52.4  3e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>