More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1657 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 715 aa  1432    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  58.88 
 
 		 698 aa  804    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  91.34 
 
 		 713 aa  1298    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  58.15 
 
 		 700 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  76.72 
 
 		 716 aa  1107    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  98.19 
 
 		 717 aa  1409    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  55.06 
 
 		 733 aa  790    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  74.33 
 
 		 702 aa  1076    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  75.93 
 
 		 706 aa  1055    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  42.26 
 
 		 714 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  43.58 
 
 		 681 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  38.73 
 
 		 727 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 		 742 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 737 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 734 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 736 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 726 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  42.28 
 
 		 664 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 681 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 678 aa  361  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  34.72 
 
 		 712 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 688 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 690 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  31.69 
 
 		 690 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 708 aa  237  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 718 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 800 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  30.31 
 
 		 715 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 739 aa  218  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 712 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 702 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 740 aa  212  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 720 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 787 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 785 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 688 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 680 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 675 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 731 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 776 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 776 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 774 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 691 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 709 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 706 aa  128  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 697 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 694 aa  124  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.78 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 723 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  24.51 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 705 aa  117  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 678 aa  114  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 780 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 680 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 682 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 688 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.12 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.12 
 
 		 721 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.12 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 705 aa  108  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.12 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 791 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.92 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.96 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.92 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 700 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 801 aa  104  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 791 aa  101  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 720 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 687 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.57 
 
 		 712 aa  98.2  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 770 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 696 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.84 
 
 		 762 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 715 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 718 aa  93.2  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.12 
 
 		 681 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 778 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.65 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  22.17 
 
 		 716 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.63 
 
 		 784 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.61 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 769 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>