37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1649 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  99.61 
 
 		 266 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  91.02 
 
 		 256 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  53.67 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  53.28 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  52.36 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  36.76 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  37.15 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  42.02 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  34.7 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  38.98 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  39.41 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  36.54 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  48.44 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  51.56 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.89 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  35.54 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  35.54 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.71 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  48.33 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  29.96 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  39.29 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  35.54 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  35.92 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  25.3 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  26.04 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  34.31 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  34.31 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.9 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  48.21 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  51.02 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  40.74 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  49.21 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  46.43 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.63 
 
 		 275 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  36.63 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>