144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1602 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 		 434 aa  888    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  46.78 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  44.25 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  44.42 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  44.16 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  39.15 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  40.91 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  40.66 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  39.45 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  43.44 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  39.45 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  42.05 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  39.42 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  39.18 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  40.35 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  35.95 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  35.68 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  34.88 
 
 		 420 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  35.37 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  35.11 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  36.92 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  39.66 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.88 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.88 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.88 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  33.89 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  39.77 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  34.87 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  33.25 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  33.25 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  35.36 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  36.76 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.99 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.4 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  32.48 
 
 		 473 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.31 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.5 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.46 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.53 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  35.47 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  31.47 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.17 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  30.9 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  30.6 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  31.7 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  30.61 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.91 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  28.27 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  29.55 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  30.97 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  28.3 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  32.22 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  32.49 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  32.25 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  27.4 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  31.15 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  31.37 
 
 		 544 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  31.44 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  31.27 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  35.35 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.68 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  32.49 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  28.64 
 
 		 833 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.37 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  28.64 
 
 		 859 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  28.64 
 
 		 833 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  27.99 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  28.85 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  27.29 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  28.24 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  27.74 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  29.25 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.68 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.82 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  28.42 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  27.74 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  28.81 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.15 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  27.71 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.62 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  31.93 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  29.08 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.42 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  25.19 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  26.02 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  27.73 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.91 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.91 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.21 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.72 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.72 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  29.49 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  30.2 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  26.01 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.8 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.7 
 
 		 372 aa  97.1  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>