121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1465 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
240 aa  483  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  99.58 
 
 
240 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  86.67 
 
 
240 aa  399  1e-110  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  45.18 
 
 
243 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  45.78 
 
 
228 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  45.78 
 
 
228 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  45.33 
 
 
228 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  30.32 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  29.33 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  31.25 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  30.91 
 
 
229 aa  80.1  3e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
227 aa  76.3  5e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  26.09 
 
 
230 aa  74.3  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  26.72 
 
 
225 aa  74.7  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  23.77 
 
 
229 aa  72.8  5e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.95 
 
 
228 aa  72.8  5e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  23.45 
 
 
229 aa  72.4  7e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  23.45 
 
 
229 aa  72.4  7e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  29.61 
 
 
251 aa  70.1  3e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.42 
 
 
237 aa  68.9  6e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 
230 aa  67  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  24.66 
 
 
229 aa  66.6  3e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 
240 aa  65.1  9e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
232 aa  64.7  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
225 aa  65.1  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  30.13 
 
 
223 aa  64.3  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  27.12 
 
 
226 aa  64.3  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  28.03 
 
 
243 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.7 
 
 
241 aa  63.2  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  25.86 
 
 
223 aa  63.2  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 
228 aa  62.8  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  27.63 
 
 
232 aa  62.8  5e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
226 aa  62.4  6e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 
228 aa  62.4  6e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
236 aa  62.4  6e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  26.56 
 
 
229 aa  62  8e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  26.07 
 
 
253 aa  62  8e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 
250 aa  62  8e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  29.87 
 
 
227 aa  61.6  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 
240 aa  60.8  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  29.91 
 
 
226 aa  60.5  2e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  26.18 
 
 
243 aa  61.2  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  28.21 
 
 
247 aa  60.5  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  29.6 
 
 
225 aa  60.1  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  29.82 
 
 
226 aa  59.7  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  29.63 
 
 
243 aa  59.7  4e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  28.45 
 
 
226 aa  58.9  7e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  28.83 
 
 
244 aa  58.9  7e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  27.39 
 
 
226 aa  58.5  8e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  28.26 
 
 
210 aa  58.5  9e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  27.66 
 
 
266 aa  58.2  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 
237 aa  57.8  1e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  26.02 
 
 
240 aa  57.4  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  28.93 
 
 
237 aa  57  2e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  27.62 
 
 
226 aa  57.8  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  28.38 
 
 
238 aa  57  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  32.43 
 
 
224 aa  57.4  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 
226 aa  57  3e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  23.61 
 
 
232 aa  56.6  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 
235 aa  56.2  4e-07  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  56.2  4e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  25.65 
 
 
229 aa  56.6  4e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
233 aa  56.2  4e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  23.73 
 
 
238 aa  56.2  5e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 
226 aa  55.5  7e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  25.88 
 
 
226 aa  55.5  8e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  28.46 
 
 
288 aa  55.5  8e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  55.5  8e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 
226 aa  54.7  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  27.83 
 
 
210 aa  55.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 
226 aa  54.7  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.32 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  27.93 
 
 
226 aa  54.3  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  26.13 
 
 
226 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 
227 aa  54.3  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  21.83 
 
 
240 aa  53.5  3e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  24.77 
 
 
227 aa  53.5  3e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  28 
 
 
230 aa  53.5  3e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  23.42 
 
 
228 aa  53.1  4e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  26.79 
 
 
210 aa  53.1  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 
235 aa  52.4  6e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
214 aa  52  9e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 
228 aa  51.2  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  23.15 
 
 
226 aa  51.6  1e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
229 aa  51.6  1e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  26.2 
 
 
224 aa  50.4  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  28.82 
 
 
233 aa  50.1  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.68254e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 
231 aa  49.7  4e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
226 aa  48.9  6e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
226 aa  48.9  6e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  26.75 
 
 
236 aa  48.9  7e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
236 aa  48.9  7e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
236 aa  48.9  7e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
236 aa  48.9  7e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  26.75 
 
 
236 aa  48.9  7e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  24.11 
 
 
210 aa  48.5  9e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  23.33 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  25.32 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  31.43 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  26.69 
 
 
666 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>