More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1372 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  85.89 
 
 
424 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  88.57 
 
 
441 aa  747    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  87.99 
 
 
425 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
436 aa  881    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  98.58 
 
 
432 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  85.37 
 
 
424 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  65.14 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  66.36 
 
 
436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  68.97 
 
 
439 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  64.73 
 
 
436 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  67.61 
 
 
441 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  66.19 
 
 
437 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  64.73 
 
 
436 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  68 
 
 
437 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  64.73 
 
 
436 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  65.86 
 
 
437 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  64.37 
 
 
429 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  65.62 
 
 
437 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  65.85 
 
 
430 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  66.99 
 
 
441 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  69.48 
 
 
446 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 
419 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  58.91 
 
 
428 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  59.8 
 
 
447 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  56.62 
 
 
431 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  60.88 
 
 
438 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60.34 
 
 
441 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  58.33 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  58.91 
 
 
441 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  59.06 
 
 
443 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  58.91 
 
 
441 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  54.11 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  54.7 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  53.47 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  54.07 
 
 
429 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  54.07 
 
 
429 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  57 
 
 
447 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  56.25 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  56.19 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  60.25 
 
 
428 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 
428 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  55.45 
 
 
443 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 
443 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  52.94 
 
 
450 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.66 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  50.12 
 
 
438 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
429 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  45.19 
 
 
430 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 
430 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.87 
 
 
422 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  40.29 
 
 
421 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  38.82 
 
 
438 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  37.22 
 
 
431 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.7 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
416 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.79 
 
 
411 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
408 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
425 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.07 
 
 
418 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.09 
 
 
412 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.02 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.65 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.24 
 
 
402 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.3 
 
 
402 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
405 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.83 
 
 
412 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.3 
 
 
402 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.99 
 
 
402 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
407 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  28.95 
 
 
413 aa  143  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.05 
 
 
402 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.94 
 
 
402 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
421 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.1 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.99 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  27.04 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.81 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.32 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.81 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.75 
 
 
402 aa  136  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.48 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.47 
 
 
418 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.6 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.2 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.01 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  27.11 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.3 
 
 
412 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.67 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.65 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.3 
 
 
410 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
458 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.59 
 
 
410 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>