178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1263 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  85.51 
 
 
276 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  66.67 
 
 
274 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  60.89 
 
 
275 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  47.99 
 
 
284 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  49.03 
 
 
272 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  47.45 
 
 
283 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  49.45 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  52.26 
 
 
288 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  49.43 
 
 
284 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  48.3 
 
 
283 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  45.86 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  47.73 
 
 
275 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  45.86 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  45.93 
 
 
278 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  46.01 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  46.01 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  45.49 
 
 
278 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  47.15 
 
 
304 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  48.47 
 
 
275 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  48.47 
 
 
275 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  48.47 
 
 
275 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  40.55 
 
 
264 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  43.38 
 
 
305 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  45.95 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  43.75 
 
 
281 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  34.21 
 
 
272 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  33.46 
 
 
271 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  37.92 
 
 
288 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  35.4 
 
 
285 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  37.45 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  37.33 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  30.97 
 
 
266 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  33.33 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.29 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  30.68 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  33.59 
 
 
296 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  32.14 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  35 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  33.72 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  35 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  31.13 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  33.47 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  32.8 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  34.04 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.86 
 
 
288 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  31.44 
 
 
303 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.1 
 
 
294 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  30.97 
 
 
285 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  33.6 
 
 
277 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  29.35 
 
 
313 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  32.31 
 
 
291 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  29.27 
 
 
324 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  31.01 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  29.46 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  33.21 
 
 
284 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  33.92 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.48 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  25.11 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.99 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  34.64 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.95 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  34.19 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  34.19 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  34.19 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  34.19 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  34.84 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  34.19 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.86 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.14 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  36.3 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.93 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.63 
 
 
360 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.89 
 
 
336 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.39 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  32.39 
 
 
208 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.27 
 
 
333 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.86 
 
 
349 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.91 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  26.56 
 
 
314 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.47 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.97 
 
 
290 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  36.08 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  33.06 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  27.65 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  25.96 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.31 
 
 
1094 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.64 
 
 
407 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.65 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.56 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  30.6 
 
 
593 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  28.35 
 
 
403 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  21.25 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  31.78 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.65 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.9 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  25.78 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>