More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1223 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  302  1e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  98.68 
 
 
191 aa  298  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  96.69 
 
 
151 aa  293  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  71.21 
 
 
141 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  72.66 
 
 
141 aa  183  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 
176 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  61.31 
 
 
157 aa  178  3e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 
148 aa  178  3e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 
176 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  64.03 
 
 
155 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
145 aa  172  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 
145 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 
145 aa  167  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 
148 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.33 
 
 
152 aa  165  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
148 aa  163  6e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  162  1e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 
148 aa  161  4e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.64 
 
 
150 aa  160  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 
177 aa  160  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 
148 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 
149 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 
149 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54633e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 
144 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 
159 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  53.64 
 
 
151 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
150 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 
147 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 
149 aa  153  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.52 
 
 
152 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 
184 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
145 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 
145 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  54.36 
 
 
150 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 
149 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
142 aa  151  3e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
150 aa  151  3e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 
154 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
146 aa  150  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
152 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 
146 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
153 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  54.89 
 
 
150 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
145 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
147 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 
147 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
153 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
153 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
142 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
142 aa  147  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  145  2e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
156 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
149 aa  145  2e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
149 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 
165 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
152 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
149 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.11 
 
 
137 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
152 aa  144  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  56.92 
 
 
130 aa  143  7e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.15 
 
 
144 aa  143  8e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
147 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 
149 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 
156 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 
193 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
150 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
147 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
146 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
153 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.15 
 
 
144 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.83 
 
 
145 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.77 
 
 
145 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 
156 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
145 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
159 aa  140  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 
147 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
144 aa  140  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.14 
 
 
142 aa  139  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
149 aa  139  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  139  1e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
147 aa  139  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
156 aa  139  1e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 
151 aa  139  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
147 aa  139  2e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
151 aa  138  2e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
163 aa  139  2e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
159 aa  139  2e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
151 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 
146 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
159 aa  137  4e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 
145 aa  137  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.67198e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
144 aa  137  4e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
159 aa  137  4e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.06 
 
 
148 aa  137  5e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.92 
 
 
149 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 
151 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 
156 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
193 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
193 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
150 aa  137  8e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>