More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1137 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.38 
 
 
255 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.11 
 
 
255 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1081  oxidoreductase, putative short-chain alcohol dehydrogenase  64.43 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
255 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  57.66 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
257 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
252 aa  248  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  48.43 
 
 
256 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
282 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
256 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
253 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
248 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 
253 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  45.97 
 
 
253 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 
253 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
251 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  45.97 
 
 
253 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
252 aa  218  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
253 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
253 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35480  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.07 
 
 
208 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  47.98 
 
 
253 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
258 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
255 aa  210  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
256 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
272 aa  208  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
263 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
256 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 
251 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
257 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475195  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.78 
 
 
246 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
252 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.78 
 
 
246 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
252 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
252 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
252 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466231  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3036  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0329583  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.36 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
252 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352293  normal  0.915226 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 
258 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
253 aa  198  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
250 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
250 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
260 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
252 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
252 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  42.86 
 
 
247 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
260 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  42.06 
 
 
247 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.95 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  43.09 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
254 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  41.18 
 
 
255 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
247 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
263 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
252 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
252 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
253 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 
246 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
263 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
250 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.85 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  42.8 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
264 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
246 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
246 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.94 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.34 
 
 
257 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.13 
 
 
250 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
246 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
246 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
250 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
254 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
256 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
246 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
265 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
252 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
270 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
250 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
251 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.63 
 
 
246 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>