73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0645 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  98.88 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  77.48 
 
 		 197 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  77.3 
 
 		 184 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  68.71 
 
 		 181 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  66.25 
 
 		 174 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  67.09 
 
 		 182 aa  241  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  64.24 
 
 		 190 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  62.8 
 
 		 180 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  60.61 
 
 		 187 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  61.88 
 
 		 182 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  59.51 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  59.75 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  57.58 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  59.12 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  59.75 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  41.94 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  35.66 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  35.57 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  38.46 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  31.01 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  28.85 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  33.85 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  29.81 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  29.81 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  27.98 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  32.43 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  30.47 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  31.37 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  29.58 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  29.69 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.23 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  28.12 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.34 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  30.94 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  27.08 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  30.94 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  27.74 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  30.51 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  24.31 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 245 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>