More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0612 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  98.48 
 
 
264 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  82.95 
 
 
265 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  82.58 
 
 
264 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  82.82 
 
 
264 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  62.36 
 
 
263 aa  353  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  61.98 
 
 
263 aa  348  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  63.12 
 
 
263 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  61.54 
 
 
267 aa  333  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60.77 
 
 
263 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  59 
 
 
265 aa  329  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  60.54 
 
 
266 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  62.31 
 
 
263 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  61.63 
 
 
263 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60 
 
 
262 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  59 
 
 
264 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60 
 
 
262 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  59.62 
 
 
262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  58.4 
 
 
262 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  59.23 
 
 
262 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  57.85 
 
 
263 aa  317  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  57.47 
 
 
263 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  56.32 
 
 
263 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  56.7 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  56.7 
 
 
263 aa  306  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  54.2 
 
 
266 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  57.09 
 
 
266 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  57.09 
 
 
266 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  53.08 
 
 
261 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  53.08 
 
 
261 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  53.33 
 
 
262 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  52.69 
 
 
261 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  50.77 
 
 
261 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.19 
 
 
264 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  54.39 
 
 
273 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  53.21 
 
 
278 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  48.68 
 
 
272 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  52.11 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  53.04 
 
 
264 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.74 
 
 
274 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  44.53 
 
 
270 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.89 
 
 
267 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  41.25 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.25 
 
 
263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  45.27 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  41.57 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  41.02 
 
 
267 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  42.64 
 
 
272 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  43.08 
 
 
259 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.62 
 
 
330 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
431 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  39.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.47 
 
 
300 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  40.57 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  39.22 
 
 
255 aa  204  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  40.23 
 
 
267 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  39.84 
 
 
267 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  39.84 
 
 
267 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  39.68 
 
 
283 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  44.3 
 
 
277 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  40.31 
 
 
304 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  39.45 
 
 
267 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  41.02 
 
 
267 aa  201  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  40.98 
 
 
267 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  40.23 
 
 
267 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  41.27 
 
 
261 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  41.27 
 
 
261 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  40.23 
 
 
267 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  41.09 
 
 
322 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  39.23 
 
 
267 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  40.38 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  42.64 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  38.13 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  41.09 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.85 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  39.84 
 
 
267 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  37.89 
 
 
268 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.06 
 
 
265 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  39.84 
 
 
267 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  40.62 
 
 
267 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  39.84 
 
 
267 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.41 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  44.64 
 
 
275 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  41.47 
 
 
266 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  41.09 
 
 
353 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  39.45 
 
 
267 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  39.45 
 
 
267 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  40.38 
 
 
284 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>