127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0497 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  45.91 
 
 
843 aa  659    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  46.64 
 
 
858 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  47.44 
 
 
825 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  70.08 
 
 
790 aa  1157    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  97.86 
 
 
795 aa  1607    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  40.93 
 
 
780 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  84.93 
 
 
795 aa  1397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
795 aa  1642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  69.92 
 
 
790 aa  1152    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  48.13 
 
 
834 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  45.23 
 
 
848 aa  656    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  44.39 
 
 
784 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  43.4 
 
 
807 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  44.42 
 
 
804 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  40.29 
 
 
781 aa  611  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  43.6 
 
 
791 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  43.09 
 
 
800 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  43.87 
 
 
784 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.88 
 
 
810 aa  598  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  43.98 
 
 
791 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  43.54 
 
 
790 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.08 
 
 
786 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  42.89 
 
 
824 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  37.64 
 
 
778 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  44.1 
 
 
794 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.71 
 
 
786 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  43.28 
 
 
787 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  43.91 
 
 
789 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  42.86 
 
 
786 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  43.3 
 
 
787 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  43.3 
 
 
787 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  43.3 
 
 
787 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  42.46 
 
 
767 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  39.05 
 
 
780 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  43.69 
 
 
786 aa  562  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  41.71 
 
 
781 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  35.39 
 
 
789 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  37.82 
 
 
780 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  38.64 
 
 
777 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  35.42 
 
 
788 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  37.87 
 
 
778 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  36.6 
 
 
986 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.53 
 
 
782 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  30.42 
 
 
755 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  32.28 
 
 
780 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 
775 aa  353  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.96 
 
 
759 aa  324  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  30.32 
 
 
710 aa  324  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  28.38 
 
 
763 aa  324  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  28.29 
 
 
750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 
787 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  28.4 
 
 
789 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.72 
 
 
774 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.56 
 
 
749 aa  317  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  30.15 
 
 
752 aa  316  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  27.32 
 
 
767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  27.43 
 
 
768 aa  315  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  30.55 
 
 
755 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  30.55 
 
 
755 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.45 
 
 
778 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  30.55 
 
 
755 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 
755 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.39 
 
 
794 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  30.75 
 
 
755 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  30.75 
 
 
755 aa  310  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  30.75 
 
 
755 aa  310  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  28.01 
 
 
765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  25.75 
 
 
805 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.35 
 
 
748 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  29.36 
 
 
758 aa  305  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  29.27 
 
 
787 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  30.27 
 
 
755 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  28.71 
 
 
807 aa  304  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.5 
 
 
769 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.2 
 
 
720 aa  302  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.95 
 
 
757 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
759 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.48 
 
 
978 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  27.96 
 
 
771 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.56 
 
 
965 aa  295  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  28 
 
 
751 aa  294  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.73 
 
 
762 aa  290  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28.8 
 
 
761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.36 
 
 
777 aa  287  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.57 
 
 
752 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  30.7 
 
 
776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.8 
 
 
761 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.8 
 
 
760 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  27.44 
 
 
748 aa  260  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.76 
 
 
1050 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  31.39 
 
 
781 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.82 
 
 
753 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  28.96 
 
 
807 aa  249  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.4 
 
 
1051 aa  247  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.34 
 
 
1088 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.89 
 
 
1053 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.28 
 
 
1051 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  28.45 
 
 
704 aa  241  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.94 
 
 
807 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.78 
 
 
1053 aa  236  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>