More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0456 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  95.18 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  87.12 
 
 		 164 aa  286  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  82.14 
 
 		 171 aa  286  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  85.28 
 
 		 164 aa  284  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  58.55 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  61.03 
 
 		 149 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  59.56 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  59.56 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  60.74 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  60 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  60.94 
 
 		 208 aa  180  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  61.72 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  65.35 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  65.35 
 
 		 139 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  62.5 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  62.41 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  59.4 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  60.16 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  58.96 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  56.39 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  54.33 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  53.91 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  55.22 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 142 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  51.75 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  52.34 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  49.6 
 
 		 138 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  46.88 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  48 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  46.46 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  49.57 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.64 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 		 131 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 		 139 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  38.54 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.59 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  42.27 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  42.27 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  38 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  39.18 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  33.59 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.88 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  33.59 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  38.95 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  35.96 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  38.27 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  37 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  40 
 
 		 135 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  39.13 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  36.27 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  36.11 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  34.58 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  38.95 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  38.54 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.64 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.64 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  34.74 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.64 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  31.78 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  34.74 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.64 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.64 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  33.72 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  32.69 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>