52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0455 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  96.45 
 
 		 197 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  70 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  73.29 
 
 		 187 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  72.5 
 
 		 194 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  59.88 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  58.43 
 
 		 177 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  50.83 
 
 		 185 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  50.28 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  51.69 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  49.71 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  47.28 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  49.12 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  51.66 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  53.29 
 
 		 137 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  46.37 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  46.37 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  44.62 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  40.22 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  41.18 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  44.23 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  40.22 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  40.4 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  43.43 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  43.71 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  38.5 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  42.62 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  39.64 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  41.36 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  39.6 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  42.21 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  41.94 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  41.94 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  43.23 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  35.75 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  33.03 
 
 		 367 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  36.08 
 
 		 160 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  35.45 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  32.9 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  35.16 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  24.82 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.78 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  29.41 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  28.99 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  25.66 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  28.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  28.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>