More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0454 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  100 
 
 
334 aa  671  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  98.5 
 
 
334 aa  664  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  100 
 
 
334 aa  671  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  91.21 
 
 
332 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  88.32 
 
 
334 aa  601  1e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  88.32 
 
 
334 aa  602  1e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  79.52 
 
 
333 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  76.74 
 
 
331 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  76.74 
 
 
331 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  74.4 
 
 
333 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  73.19 
 
 
333 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  73.27 
 
 
333 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  72.73 
 
 
333 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  71.69 
 
 
333 aa  491  1e-138  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  72.29 
 
 
334 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  71.69 
 
 
333 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  71.69 
 
 
334 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  71.99 
 
 
333 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  71.69 
 
 
360 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  72.34 
 
 
333 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  71.47 
 
 
333 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  72.34 
 
 
357 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  71.73 
 
 
333 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  70.21 
 
 
334 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  69.6 
 
 
328 aa  466  1e-130  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  70.09 
 
 
330 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  70 
 
 
328 aa  458  1e-128  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  67.69 
 
 
328 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  66.46 
 
 
328 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  64 
 
 
328 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  67.38 
 
 
336 aa  411  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  66.46 
 
 
328 aa  404  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  65.85 
 
 
328 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  66.15 
 
 
328 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  56.84 
 
 
332 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  54.27 
 
 
339 aa  352  7e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  57.85 
 
 
332 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.11 
 
 
324 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  45.06 
 
 
323 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.31 
 
 
323 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  46.15 
 
 
323 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  43.4 
 
 
317 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.48 
 
 
319 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  42.86 
 
 
334 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  45.74 
 
 
319 aa  253  4e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.72 
 
 
320 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.03 
 
 
327 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  43.65 
 
 
321 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  43.17 
 
 
327 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  42.59 
 
 
311 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.14 
 
 
338 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  45.23 
 
 
327 aa  234  1e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  44.2 
 
 
274 aa  234  1e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.51 
 
 
323 aa  233  2e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  43.61 
 
 
324 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  40.81 
 
 
339 aa  230  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  43.56 
 
 
321 aa  225  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.5 
 
 
323 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1325  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.93 
 
 
315 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  42.01 
 
 
322 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.48 
 
 
315 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.89 
 
 
326 aa  223  5e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2196  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.43 
 
 
316 aa  223  5e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00601884  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5902  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.62 
 
 
327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0476763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.14 
 
 
318 aa  222  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  41.61 
 
 
318 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.51 
 
 
329 aa  221  1e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  40.19 
 
 
319 aa  221  1e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3366  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.48 
 
 
315 aa  220  2e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  42.47 
 
 
340 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.39 
 
 
322 aa  219  4e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  41.87 
 
 
341 aa  219  4e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  38.39 
 
 
322 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  39.81 
 
 
316 aa  218  8e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.87 
 
 
323 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2643  putative glycerate dehydrogenase  41.93 
 
 
316 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.24 
 
 
331 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  38.39 
 
 
322 aa  216  6e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1858  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.14 
 
 
312 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  37.34 
 
 
322 aa  215  7e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  34.38 
 
 
319 aa  215  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3326  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.39 
 
 
316 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
313 aa  214  2e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275914  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  38.92 
 
 
315 aa  214  2e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0476  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.34 
 
 
319 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.77 
 
 
335 aa  212  8e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.99 
 
 
319 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.99 
 
 
319 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  45.28 
 
 
345 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.43 
 
 
326 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  40.06 
 
 
329 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.43 
 
 
326 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.2 
 
 
312 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.54 
 
 
332 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.42 
 
 
331 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  40.75 
 
 
348 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0504  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.49 
 
 
322 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.62 
 
 
331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.11 
 
 
338 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2941  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.31 
 
 
324 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.320124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>