More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0338 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  88.1 
 
 		 354 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.32 
 
 		 353 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 353 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 353 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.25 
 
 		 347 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.54 
 
 		 347 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.26 
 
 		 344 aa  554  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.07 
 
 		 349 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.5 
 
 		 347 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.35 
 
 		 347 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.23 
 
 		 345 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.28 
 
 		 350 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.86 
 
 		 348 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.64 
 
 		 350 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 		 350 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.36 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.33 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 357 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 357 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.82 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 344 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 339 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  48.97 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 327 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 337 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 337 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 332 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 334 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 345 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 335 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 332 aa  295  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 334 aa  292  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 334 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  43.53 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>