80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0084 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  37.62 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  39.11 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  35.86 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  35 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  26.96 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  36.62 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  32.69 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  32.53 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  35.93 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  28.98 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  28.85 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  27.91 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  28.95 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  34.73 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  25 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.14 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35.48 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  26.5 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  26.5 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  26.5 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  32.17 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  33.61 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  26.28 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  23.81 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  30.22 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  27.55 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  27.21 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  31.85 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  31.38 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  29.5 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  32.33 
 
 		 493 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  25.86 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  28.89 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  30.34 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  25.86 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.09 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  26.88 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  33.87 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  25.95 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  29.11 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  23.72 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  31.97 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.97 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  32.33 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  25.77 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  21.82 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  27.52 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  21.99 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.24 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  28.57 
 
 		 128 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.06 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  24.37 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  24.37 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  23.4 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  28.03 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.82 
 
 		 698 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  31.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  34.86 
 
 		 355 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6502  restriction endonuclease  26.61 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.843252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  36.05 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  26.72 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  30.89 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  25.85 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  20.83 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.46 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0911  hypothetical protein  42.37 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.514281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  27.93 
 
 		 853 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>