147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0070 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  84.31 
 
 
215 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  73.53 
 
 
208 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  73.53 
 
 
207 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 
208 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  75.51 
 
 
209 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  75.51 
 
 
209 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  72.55 
 
 
208 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  75.51 
 
 
209 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  72.55 
 
 
208 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 
208 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  71.57 
 
 
208 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 
208 aa  157  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  71.57 
 
 
208 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  70.59 
 
 
208 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 
208 aa  157  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  74.49 
 
 
209 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  74.49 
 
 
209 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  71.57 
 
 
208 aa  157  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  74.49 
 
 
209 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  74.49 
 
 
209 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  68.32 
 
 
208 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  69.61 
 
 
206 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  69.9 
 
 
210 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  69.61 
 
 
204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  67.65 
 
 
208 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  67.65 
 
 
206 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  67.65 
 
 
206 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  67.65 
 
 
206 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  68.63 
 
 
215 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  65.35 
 
 
208 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  66.99 
 
 
208 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  66.99 
 
 
208 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  66.99 
 
 
208 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  66.67 
 
 
205 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  66.67 
 
 
205 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 
208 aa  146  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  65.05 
 
 
211 aa  137  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  64.95 
 
 
210 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  57.73 
 
 
224 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  60.78 
 
 
214 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  60.78 
 
 
214 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  59.8 
 
 
214 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  59.8 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  59.8 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  59.8 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  59.22 
 
 
211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  57.84 
 
 
214 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 
224 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
226 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  43.52 
 
 
226 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  42.59 
 
 
226 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  42.59 
 
 
226 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  42.59 
 
 
226 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
226 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  43.16 
 
 
229 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  43.52 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  43.52 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  43.52 
 
 
226 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  42.59 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  42.59 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  42.59 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  42.59 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  43.52 
 
 
226 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  42.59 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  39.81 
 
 
225 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  42.59 
 
 
226 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 
225 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  45.05 
 
 
225 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  37.93 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 
250 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 
201 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 
216 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 
216 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
217 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
216 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 
228 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
217 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  34.48 
 
 
228 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  35.79 
 
 
214 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
216 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5362  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
228 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  35.79 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
229 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
216 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
228 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
213 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  32.58 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  32.58 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>