18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0062 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  95.35 
 
 
86 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  82.93 
 
 
85 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  80.72 
 
 
86 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  51.19 
 
 
82 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3378  hypothetical protein  67.27 
 
 
71 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  41.38 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  42.17 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  35.44 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  41.46 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  37.97 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  36.71 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  41.77 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>