More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0040 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  94.24 
 
 
243 aa  480  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  63.64 
 
 
287 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  64.2 
 
 
242 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  63.64 
 
 
287 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  63.64 
 
 
287 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  62.4 
 
 
287 aa  325  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  62.4 
 
 
287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  62.4 
 
 
287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  61.98 
 
 
287 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  61.98 
 
 
287 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  61.98 
 
 
287 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  61.98 
 
 
287 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  62.55 
 
 
242 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  62.55 
 
 
242 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  61.73 
 
 
244 aa  310  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  61.32 
 
 
242 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  61.32 
 
 
242 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  61.32 
 
 
242 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  60.58 
 
 
247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  59.26 
 
 
242 aa  301  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  60.91 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  60.91 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  60.49 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  58.85 
 
 
242 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  57.92 
 
 
245 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  57.92 
 
 
245 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  57.92 
 
 
245 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  64.79 
 
 
217 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  56.85 
 
 
245 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  57.08 
 
 
245 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  55 
 
 
239 aa  274  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  55.32 
 
 
269 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  55.32 
 
 
269 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  55.04 
 
 
268 aa  266  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  53.75 
 
 
261 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  53.75 
 
 
261 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  55.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  55.46 
 
 
277 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  55.46 
 
 
277 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  53.75 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  53.75 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3577  IstB domain protein ATP-binding protein  55.79 
 
 
242 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1489  IstB domain protein ATP-binding protein  55.79 
 
 
242 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  55.65 
 
 
245 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  54.62 
 
 
259 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  54.62 
 
 
259 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  54.62 
 
 
259 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  53.09 
 
 
260 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  53.09 
 
 
261 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  53.19 
 
 
264 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  53.19 
 
 
264 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  53.19 
 
 
264 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  54.04 
 
 
260 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  59.62 
 
 
253 aa  255  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  52.77 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  55.46 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  53.78 
 
 
256 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  53.78 
 
 
256 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  55.17 
 
 
277 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  53.78 
 
 
256 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  53.78 
 
 
256 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  53.14 
 
 
267 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  53.78 
 
 
256 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  53.68 
 
 
265 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  54.24 
 
 
269 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  53.22 
 
 
275 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  50.43 
 
 
266 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2721  IstB ATP binding domain-containing protein  69.92 
 
 
140 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  74.76 
 
 
356 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  50 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  43 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  38.36 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  38.36 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>