20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0018 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  96.4 
 
 
278 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  73.93 
 
 
273 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  38.11 
 
 
297 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  43.32 
 
 
290 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  36.59 
 
 
293 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  34.54 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  35.48 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  29.61 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  35.2 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  34.27 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  32.42 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  30.3 
 
 
362 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  48.44 
 
 
567 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  32.31 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  40.66 
 
 
189 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  39.56 
 
 
189 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  36.96 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>