33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0011 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  86.04 
 
 		 394 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  96.16 
 
 		 391 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  31.46 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  27.53 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  29.72 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  28.68 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  26.49 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  25.2 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  27.97 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  30.79 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  30.1 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  27.98 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  29.02 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  27.51 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  27.47 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  28.61 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  28.78 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  26.56 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  28.07 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  25.61 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  24.38 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  26.78 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  20.41 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  20.77 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  22.19 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  19.9 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  19.58 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  23.12 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  22.6 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  25.26 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  29.5 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  29.75 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>