46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2409 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  679    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  50.88 
 
 
348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  45.77 
 
 
344 aa  318  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  43.7 
 
 
347 aa  299  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  38.3 
 
 
346 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  32.95 
 
 
347 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  35.24 
 
 
352 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  35.51 
 
 
338 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  31.67 
 
 
347 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  35.69 
 
 
366 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  32.93 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  29.82 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.05 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  30.63 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  28.44 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  26.74 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  24.27 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  25.35 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25.59 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.77 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.24 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  22.68 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  19.25 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.09 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  24.47 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.81 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.6 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  22.92 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  34.57 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.41 
 
 
338 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  22.77 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  27.42 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.87 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  26.77 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  23.05 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  29.6 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  22.76 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  24.16 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  23.48 
 
 
317 aa  46.6  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  22.91 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  30.88 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  34.21 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  29.41 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  28.43 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  28.4 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>