More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2403 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
371 aa  756    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  64.33 
 
 
456 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
765 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
763 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  51.76 
 
 
1046 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  52.16 
 
 
729 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
582 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1069 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
682 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0380  histidine kinase  56.09 
 
 
235 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0756156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
940 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
396 aa  233  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
1369 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
767 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
1022 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  37.57 
 
 
853 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.79 
 
 
1683 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
507 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
955 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
1237 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
862 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
896 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
919 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
957 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
785 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1266 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
573 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 
687 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1548 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.56 
 
 
1135 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 
1203 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
995 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  34.97 
 
 
1255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
568 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.81 
 
 
882 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1003 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
881 aa  212  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 
1765 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1771 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  38.57 
 
 
2035 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1767 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.66 
 
 
1267 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 
932 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
436 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
947 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.83 
 
 
1763 aa  209  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  39.73 
 
 
1353 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
1165 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1055 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1767 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1767 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
765 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  35.88 
 
 
1119 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
738 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
916 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.04 
 
 
508 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.54 
 
 
1023 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
490 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
1313 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
780 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
1433 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1410 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
704 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
1007 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
874 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
1260 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
969 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
1128 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
605 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
631 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1041 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
916 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1326 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
674 aa  202  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  45.53 
 
 
565 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1118 aa  202  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1765 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1352 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.15 
 
 
852 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
882 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  41.54 
 
 
761 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1222 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
1314 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1792 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1786 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
973 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0679  sensory transduction histidine kinase  43.37 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.502245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.99 
 
 
823 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1058 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
911 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1784 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.26 
 
 
2213 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1075 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
778 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  45.67 
 
 
1179 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1782 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>