154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2397 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 
362 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  71.75 
 
 
365 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  50.7 
 
 
357 aa  359  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  51.69 
 
 
372 aa  347  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  53.59 
 
 
355 aa  343  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  49.28 
 
 
350 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.85 
 
 
363 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  51 
 
 
360 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.14 
 
 
359 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.8 
 
 
354 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.09 
 
 
355 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.66 
 
 
355 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.66 
 
 
356 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.94 
 
 
355 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.61 
 
 
344 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.98 
 
 
356 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.43 
 
 
346 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.24 
 
 
341 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.24 
 
 
341 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.62 
 
 
366 aa  269  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.32 
 
 
345 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  44.07 
 
 
340 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.73 
 
 
347 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.87 
 
 
337 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.1 
 
 
345 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.42 
 
 
350 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.48 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.53 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.29 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.17 
 
 
343 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  42.73 
 
 
338 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.93 
 
 
361 aa  249  6e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.82 
 
 
353 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.14 
 
 
351 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.41 
 
 
354 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.06 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.01 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.81 
 
 
349 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.79 
 
 
346 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.11 
 
 
357 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  41.27 
 
 
339 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.76 
 
 
342 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.83 
 
 
339 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.09 
 
 
348 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.09 
 
 
348 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.09 
 
 
348 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.48 
 
 
360 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39 
 
 
374 aa  229  4e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.62 
 
 
352 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.72 
 
 
377 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.82 
 
 
351 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.69 
 
 
352 aa  225  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.25 
 
 
342 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.83 
 
 
350 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.99 
 
 
363 aa  222  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.11 
 
 
361 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.84 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.68 
 
 
357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.24 
 
 
357 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  39.88 
 
 
349 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.55 
 
 
354 aa  217  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.4 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.16 
 
 
349 aa  212  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.16 
 
 
349 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.16 
 
 
349 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.44 
 
 
349 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.62 
 
 
349 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.16 
 
 
349 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.62 
 
 
349 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.62 
 
 
349 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.43 
 
 
349 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.34 
 
 
349 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.34 
 
 
349 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.95 
 
 
342 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.93 
 
 
342 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  34.73 
 
 
362 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.17 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.61 
 
 
350 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.75 
 
 
352 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.14 
 
 
336 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.77 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.77 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.9 
 
 
349 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  36.34 
 
 
779 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.1 
 
 
349 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.83 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.33 
 
 
359 aa  173  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.43 
 
 
341 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.63 
 
 
348 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.56 
 
 
335 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.37 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.23 
 
 
367 aa  133  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  29.31 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1722  L-lactate oxidase  26.74 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.111357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1257  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  27.36 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09014  FMN-dependent dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02300)  24.09 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219396  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1798  L-lactate oxidase  26.8 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1734  L-lactate oxidase  26.8 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613324  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2255  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  27.65 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1737  L-lactate oxidase  26.52 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>