More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2268 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3702  protease  51.14 
 
 
878 aa  863    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  100 
 
 
826 aa  1684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  31.91 
 
 
886 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  32.19 
 
 
810 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  30.33 
 
 
839 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  31.32 
 
 
836 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  31.28 
 
 
835 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  30.98 
 
 
847 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.3 
 
 
783 aa  347  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  29.85 
 
 
835 aa  344  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  31.21 
 
 
835 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  29.05 
 
 
828 aa  340  8e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  29.05 
 
 
838 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  30.01 
 
 
848 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  28.51 
 
 
862 aa  334  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  29.64 
 
 
783 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  29.25 
 
 
783 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  28.91 
 
 
783 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  30.47 
 
 
839 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  28.08 
 
 
837 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  28.02 
 
 
835 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.69 
 
 
817 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  26.69 
 
 
872 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  27.12 
 
 
877 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.28 
 
 
826 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  28.66 
 
 
823 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  28.15 
 
 
841 aa  287  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  30.18 
 
 
767 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  29.15 
 
 
825 aa  285  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  28.17 
 
 
833 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  28.71 
 
 
851 aa  277  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.6 
 
 
736 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  27.96 
 
 
840 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  29.91 
 
 
723 aa  273  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  32.72 
 
 
716 aa  271  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  29.86 
 
 
832 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  35.18 
 
 
790 aa  265  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  26.47 
 
 
852 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  29.14 
 
 
805 aa  264  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  30.98 
 
 
722 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  28.24 
 
 
843 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.77 
 
 
792 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  30.26 
 
 
822 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  26.74 
 
 
847 aa  250  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  32.07 
 
 
790 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  26.8 
 
 
792 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  31.84 
 
 
790 aa  241  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  31.46 
 
 
790 aa  237  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  30.13 
 
 
818 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  26.81 
 
 
876 aa  227  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  30.73 
 
 
621 aa  227  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  30.39 
 
 
653 aa  224  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  30.39 
 
 
667 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.39 
 
 
653 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.39 
 
 
653 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.39 
 
 
667 aa  224  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  30.39 
 
 
667 aa  224  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  30.21 
 
 
653 aa  224  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  30.39 
 
 
667 aa  224  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  26.46 
 
 
873 aa  223  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  32.53 
 
 
834 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  31.81 
 
 
629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  32.74 
 
 
419 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  32.58 
 
 
406 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.03 
 
 
411 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  34.55 
 
 
411 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  39 
 
 
747 aa  213  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  38.08 
 
 
746 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  35.08 
 
 
422 aa  211  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  29.47 
 
 
654 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  36.26 
 
 
696 aa  210  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  29.28 
 
 
654 aa  210  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30 
 
 
622 aa  210  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  29.28 
 
 
654 aa  210  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  29.89 
 
 
654 aa  210  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  32.07 
 
 
427 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  36.36 
 
 
430 aa  209  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  32.15 
 
 
746 aa  208  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  29.09 
 
 
654 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  29.09 
 
 
654 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  30.77 
 
 
635 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  36.89 
 
 
413 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  36.88 
 
 
411 aa  206  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  29.73 
 
 
652 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  30.68 
 
 
667 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  34.11 
 
 
405 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  35.87 
 
 
413 aa  204  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  35.05 
 
 
407 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.43 
 
 
404 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  36.33 
 
 
805 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  32.91 
 
 
409 aa  201  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  32.07 
 
 
403 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  32.08 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  33.97 
 
 
404 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  32.65 
 
 
409 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  34.3 
 
 
420 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  33.44 
 
 
430 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  30.47 
 
 
669 aa  198  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  30.84 
 
 
666 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  30.84 
 
 
666 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>