27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2258 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  54.19 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.77 
 
 
206 aa  185  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  42.11 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  34.3 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.79 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
213 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  30.93 
 
 
199 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.21 
 
 
213 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.68 
 
 
231 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  34.31 
 
 
192 aa  101  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  35.75 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  32.32 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  53.01 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  29.61 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.12 
 
 
217 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  32.62 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.17 
 
 
145 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  30.73 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  52.31 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  34.83 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  37.08 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  37.08 
 
 
158 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>