More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2219 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  100 
 
 
384 aa  752    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  56.66 
 
 
399 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
385 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
391 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  28.61 
 
 
386 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
400 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.92 
 
 
405 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
407 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.22 
 
 
406 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
400 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  26.89 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.07 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
399 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
420 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  26.42 
 
 
394 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
381 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
396 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  26.42 
 
 
393 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
393 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
415 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  27.43 
 
 
409 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
393 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 
388 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  25.14 
 
 
409 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  26.21 
 
 
474 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  26 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  25.71 
 
 
432 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  25.43 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
392 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.58 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
388 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  24.62 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  24.03 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  26.47 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  22.93 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.64 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  22.44 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  31 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  25.26 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  20.45 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  29.69 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.76 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.49 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  27.2 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.42 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.11 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.67 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  25.08 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.31 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.51 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.43 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
469 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.6 
 
 
520 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.08 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  25.49 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  28.63 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  29.41 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.08 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  28.63 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  25.7 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  28.63 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.07 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.7 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  22.88 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  22.88 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  23.68 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  24.18 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  23.16 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  22.88 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.7 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.8 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  27.07 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  30.86 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  21.73 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.24 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>