39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2112 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  35.12 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  34.76 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  36.45 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  30.54 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  33.67 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  35 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 89 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 97 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 93 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>