34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2101 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  69.6 
 
 
125 aa  180  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  61.29 
 
 
127 aa  154  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  53.6 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  51.61 
 
 
125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  50.81 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  56.91 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  51.2 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  50.4 
 
 
125 aa  128  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  48.78 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  53.97 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  53.17 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  53.6 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  53.6 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  52.85 
 
 
128 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  52.85 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  52.03 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  50.41 
 
 
128 aa  118  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  50 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  53.6 
 
 
123 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  41.6 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  44 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  53.85 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  40.8 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  39.52 
 
 
131 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  52.5 
 
 
131 aa  84  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  47.5 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  38.98 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  39.39 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  36.89 
 
 
201 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  37 
 
 
208 aa  55.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.25 
 
 
220 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70383  Killer toxin Resistant  33.33 
 
 
261 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.650262 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  34.02 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>