More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2100 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  70.99 
 
 
163 aa  240  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
159 aa  192  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
159 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 
163 aa  156  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
163 aa  154  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
160 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
160 aa  153  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  42.24 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
167 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
160 aa  148  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 
162 aa  147  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
163 aa  147  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
178 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  38.12 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  37.82 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  40.12 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  39.51 
 
 
168 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 
161 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
160 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  37.82 
 
 
162 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  37.2 
 
 
164 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
163 aa  117  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
162 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  26 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  26 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  26.03 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  25.16 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  25.52 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  26.71 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
196 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  28.1 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.03 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  25.66 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.53 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>