More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2068 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  100 
 
 		 392 aa  805    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  62.76 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  46.91 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  46.91 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  48.05 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  44.9 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  45.8 
 
 		 880 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 878 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  46.65 
 
 		 896 aa  325  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.79 
 
 		 409 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.21 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.66 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.39 
 
 		 413 aa  319  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.22 
 
 		 885 aa  319  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.54 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.37 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  40.4 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  40.4 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  40.4 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  40.4 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  40.66 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  40.4 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 413 aa  312  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 413 aa  312  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  41.71 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  43.44 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.85 
 
 		 413 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.4 
 
 		 413 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  41.5 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  40.2 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  38.9 
 
 		 410 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.5 
 
 		 414 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  40.66 
 
 		 879 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.65 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  40 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.13 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.35 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  40 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.31 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.03 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.85 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  41 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 406 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  39.65 
 
 		 406 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.37 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  41.15 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  38.25 
 
 		 414 aa  292  7e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.26 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.28 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  39.8 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.67 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.65 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.39 
 
 		 414 aa  289  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  38.93 
 
 		 424 aa  289  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.33 
 
 		 406 aa  288  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.5 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.07 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.07 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.33 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.57 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  37.93 
 
 		 405 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  37.78 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.09 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  39 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  37.5 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  37.93 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.56 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.48 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  38.99 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  38.11 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  40.25 
 
 		 414 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.29 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  38.21 
 
 		 423 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.61 
 
 		 629 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.75 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.67 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  39.1 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.76 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 626 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.27 
 
 		 412 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.63 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.86 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.2 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.25 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>