79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1999 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  52.07 
 
 
242 aa  244  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  42.53 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  34.35 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  33.47 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  33.47 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  30.83 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  34.33 
 
 
238 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  34.33 
 
 
238 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 
259 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 
252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 
252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 
252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29 
 
 
228 aa  105  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.55 
 
 
259 aa  105  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.81 
 
 
218 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  34.86 
 
 
218 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  29.31 
 
 
263 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.72 
 
 
218 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.4 
 
 
218 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  31.65 
 
 
252 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  35.02 
 
 
224 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  101  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  31.65 
 
 
252 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.65 
 
 
252 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  35.06 
 
 
253 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.42 
 
 
218 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  31.96 
 
 
209 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  35.11 
 
 
293 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  34.51 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.58 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  30.67 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  32.03 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  33.19 
 
 
300 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.92 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.51 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.94 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.52 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  34.76 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.95 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.34 
 
 
222 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  33.18 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.54 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  29.38 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  27.98 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  30.68 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  30.09 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  28.11 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  30.92 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  32.47 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.18 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.22 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  28.22 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.34 
 
 
295 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  28.05 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  27.01 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  34.19 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.89 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.28 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  29.58 
 
 
526 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  28.5 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  25.46 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  27.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  28.92 
 
 
1571 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  29.41 
 
 
473 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  25.87 
 
 
613 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  28.9 
 
 
1611 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  24.55 
 
 
688 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.572044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1285  3-dehydroquinate dehydratase, putative (AroD)  25.71 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  23.87 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1640  3-dehydroquinate dehydratase, type 1, putative/shikimate 5-dehydrogenase, putative  25.89 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0649  bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase protein  35.21 
 
 
478 aa  46.2  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  21.72 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.438202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1543  3-dehydroquinate dehydratase-like protein  25.17 
 
 
485 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0773845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>