More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1925 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  897    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  50 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  47.22 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  45.64 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  46.06 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  46.67 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  41.28 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  40.22 
 
 		 455 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  40.58 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  40.37 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  40.5 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  41.86 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  39.27 
 
 		 442 aa  310  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  39.21 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  36.65 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  38.78 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  39.38 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  36.04 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  34.08 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  38.24 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  35.19 
 
 		 464 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  38.16 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  33.84 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  34.11 
 
 		 455 aa  246  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.53 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  36.09 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  33.7 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  34.28 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 466 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  33.11 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  33.57 
 
 		 451 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  33.26 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  31.71 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  31.54 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  31.22 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  33.33 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  31.37 
 
 		 466 aa  219  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  34.33 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 493 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.14 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  32.97 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 468 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.71 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  34.37 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 440 aa  209  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  31.04 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28.83 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  34.91 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 460 aa  193  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 454 aa  192  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  30.27 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.39 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  29.93 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.48 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  30.36 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.73 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.78 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>