More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1851 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  62.35 
 
 
88 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  56.18 
 
 
90 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  51.69 
 
 
91 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  52.81 
 
 
102 aa  100  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  50.56 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  47.06 
 
 
98 aa  98.2  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  47.06 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  49.38 
 
 
104 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  55.41 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.19 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  46.51 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  46.99 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  52.44 
 
 
104 aa  87  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  44.71 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.18 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  51.95 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  44.71 
 
 
105 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  44.71 
 
 
105 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  40.86 
 
 
95 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  43.53 
 
 
105 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  41.86 
 
 
105 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.75 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  44.71 
 
 
104 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.35 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  42.35 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  46.34 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  40.23 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  44.05 
 
 
100 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  49.33 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  43.59 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  45.88 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  42.05 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  39.77 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  41.18 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  48.75 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  42.05 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  50.68 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  46.91 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  45.88 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  42.86 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  42.68 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  40.48 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  43.53 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  40.48 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  42.05 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.12 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  42.05 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.96 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  39.29 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.35 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  41.98 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  45.68 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  43.9 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  41.43 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  41.98 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  40.7 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.53 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  37.21 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  43.59 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  38.64 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.18 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  40 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  39.76 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  38.82 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  42.35 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.59 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  45.71 
 
 
106 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  48.15 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45.21 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  39.02 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.55 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  41.67 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  42.35 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.03 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.65 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.55 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  38.82 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  43.9 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  41.03 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35.96 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  40.91 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  40.91 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.76 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  40.91 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>